El Club Deportivo Juventud Nonguén fue fundado en la década de 1960, en una época en la que Nonguén era mayormente rural y sus habitantes buscaban maneras de fomentar la cohesión social y ofrecer actividades recreativas para los jóvenes.
El club ha tenido una larga trayectoria en el fútbol amateur de la zona, participando en distintas ligas y torneos locales.
A lo largo de su historia, el Club ha logrado importantes logros deportivos, destacándose por su compromiso con el desarrollo del fútbol en la región. El club ha sido un semillero de talentos y ha formado a numerosos jugadores que luego han destacado en el fútbol profesional chileno.